Laboratorio de Biofísica Teórica y Computacional
En LBTyC estudiamos proteinas desde una perspectiva física y computacional, combinando simulaciones moleculares, análisis de redes, y herramientas de inteligencia artificial. Buscamos comprender cómo la estructura y la dinámica molecular determinan la función biológica y utilizar ese conocimientio para abordar problemas de relevancia biomédica.
Novedades
La glicosilación modula la dinámica y la comunicación a larga distancia en proteínas
En un trabajo reciente estudiamos mediante simulaciones de dinámica molecular el efecto de la glicosilación sobre el receptor de manosa CD206. Nuestros resultados muestran que la eliminación de glicanos no produce únicamente cambios locales, sino que modifica la flexibilidad y el acoplamiento entre regiones distantes de la proteína, favoreciendo la aparición de una nueva conformación.
Este trabajo muestra cómo perturbaciones moleculares locales pueden propagarse a través de una proteína y modificar su comportamiento global, una de las preguntas centrales que abordamos desde la biofísica computacional.
Investigación
En el LBTyC estudiamos cómo funcionan las proteínas y otros sistemas biomoleculares desde un punto de vista físico. Buscamos comprender las relaciones entre estructura, dinámica y función mediante simulaciones moleculares, métodos de biofísica computacional e inteligencia artificial.
Nuestro trabajo combina investigación fundamental, orientada a comprender los principios físicos que gobiernan el comportamiento de los sistemas biomoleculares, con investigación aplicada, en la que utilizamos ese conocimiento para abordar problemas biomédicos y contribuir al diseño racional de nuevas estrategias terapéuticas.
En particular, actualmente estamos interesados en estos temas:
Diseño de vacunas
Estudiamos la dinámica de antígenos y epítopos para identificar regiones con propiedades favorables para el diseño racional de vacunas contra la enfermedad de Chagas.
Deep learning y diseño de péptidos
Desarrollamos un algoritmo para identificar y caracterizar los estados conformacionales del receptor CXCR3, con el objetivo de diseñar péptidos capaces de modular o inhibir su actividad.
Péptidos contra el glioblastoma
Exploramos nuevas funciones de SNAP25 en glioblastoma y utilizamos este conocimiento para diseñar péptidos nuevos con potencial terapéutico y aplicaciones futuras.
Diseño de péptidos
Diseñamos y estudiamos péptidos cíclicos capaces de reconocer proteínas de interés terapéutico, combinando modelado molecular y simulaciones para optimizar su interacción con el blanco.
Entropía molecular
Desarrollamos métodos para calcular contribuciones entrópicas a la energía libre y comprender su papel en el reconocimiento molecular, con especial interés en complejos proteína–péptido.
En cuanto a las herramientas que usamos, ellas son mayormente métodos teóricos y simulaciones moleculares computacionales.
Nuestro equipo
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Donaciones
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